甲种胎儿蛋白简称甲胎蛋白（AFP），是原发性肝癌的主要诊断指标。甲胎蛋白在正常人血中的含量不应超过20ng/ml，如果超过了，则为异常。超过越多，患肝癌的可能性就越大。甲胎蛋白是诊断肝癌的一个有力指标。大多数情况下，只要出现甲胎蛋白阳性，一般就可以作为肝癌的诊断依据，应该引起高度注意。但医生们指出，没有一种肿瘤标记能兼顾百分之百的特异性及敏感度，因此不能大意，要结合采用其他方法。甲胎蛋白对于肝癌有较强的诊断性如果甲胎超过500大于四周，超过200持续八周就高度怀疑了肿瘤表面标志物之一，作为疾病筛选的初级普查方法。对肝脏疾病特别是肝癌有比较高的特异性。
检测甲胎蛋白的方法有好几种，放射免疫法测得的甲胎蛋白大于500微克／升、且持续4周者，或甲胎蛋白在200～500微克／升、持续8周者，在排除其它引起甲胎蛋白增高的因素如急、慢性肝炎、肝炎后肝硬化、胚胎瘤、消化道癌症后，需再结合定位检查，如B超、CT、磁共振（MRI）和肝血管造影等即可作出诊断。
不过，正常怀孕的妇女、少数肝炎和肝硬化、生殖腺恶性肿瘤等情况下甲胎蛋白也会升高，但升高的幅度不如肝癌那样高。肝硬化病人血清甲胎蛋白浓度多在25～200微克／升之间，一般在2个月内随病情的好转而下降，多数不会超过2个月；同时伴有转氨酶升高，当转氨酶下降后甲胎蛋白也随之下降，血清甲胎蛋白浓度常与转氨酶呈平行关系。放射免疫法测得的甲胎蛋白大于500微克／升、且持续4周者，或甲胎蛋白在200～500微克／升、持续8周者，在排除其它引起甲胎蛋白增高的因素如急、慢性肝炎、肝炎后肝硬化、胚胎瘤、消化道癌症后，需再结合定位检查，如B超、CT、磁共振（MRI）和肝血管造影等即可作出诊断。
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