计算机辅助蛋白质设计
主题词或关键词: 生命科学 生物工程 蛋白质
计算机辅助蛋白质设计(CAPD)是指在蛋白质工程中,应用计算机技术,通过对已知的蛋白质顺序、分子构象、结构与功能关系等数据的分机处理,预测和评估蛋白质改造中各种方案,做出最佳选择,具体地讲,是蛋白质工程中蛋白质设计的软件的研究。
CAPD研究的内容也就是应用软件的开发,包括数据分析处理算法的研究,蛋白质设计模拟模型的建立以及计算机程序编写和软件可用性的研究。
计算机在生物研究中的应用,除了一般性数据分析外,最早的是用于对蛋白质以及DNA顺序中相似性的分析,随后,有人开始DNA二级结构的分析。70年代以来,随着计算机技术的发展和蛋白质顺序、结构等方面数据的积累以及蛋白质工程的崛起,CAPD技术才有了迅猛的发展。目前,许多CAPD软件已进入应用,CAPD技术日趋成熟。
CAPD在蛋白质设计中具有许多优越性,CAPD能够分析各种改造方案,其容量和速度是人力所不能及的。CAPD能够对各种改造方案做出比较、评估,当我们选择的标准和积累的数据更准、更多时,CAPD对各种方案的预测也更加准确,其应用潜力也就越大。
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