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| 菊花 |
在分类学中，一个物种被赋予一个拉丁化的双名法名称。该名称使用斜体或是加上底线（现在较少见）印刷；属名首字母大写，属名之后紧跟一个唯一的形容词，这个词称为种小名或种加词，其首字母不可大写。只有完整的双名制名称才称为“种名”，而非仅仅是双名制名称的第二个部分。例如人的种名叫Homosapiens（有智慧的人），而不是sapiens。
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| 甲虫 |
形态学种（morphologicalspecies）是一群在外观上不同的生物，例如我们可以分辨出鸡和鸭，因为它们长着不同形状的喙，而且鸭子的足有蹼。在有记录的历史之前，物种就已经像这样定义了。尽管受到不少批评，形态学种的概念仍然是日常生活中最常使用的物种概念，而且在生物学中依然扮演着重要角色，尤其是在植物学中。
生物学种或隔离种概念把物种定义为一组能够或潜在能够相互培育的生物。对于研究现存高等生物，如哺乳类、鱼类和鸟类的科学家来说，这不失为一种简洁的表达方式；但对于不进行有性生殖的生物来说，这个定义是毫无意义的。它把互相配育在理论上的可能性和种群间基因流动的可能性区分开来。例如马和驴杂交是可行的，并且能够产生后代，然而它们仍然属于两个种。这有两个原因：第一，因为在野生状态下，马和驴通常不会杂交。第二，因为它们结合产生的后代很少具有繁殖能力。定义生物学种的关键在于两个种群间没有显著的基因物质交流。
配偶识别种定义了一群能够把种群中的其它个体识别为潜在配偶的生物。正如上述隔离种的概念那样，它仅适用于进行有性生殖的生物。
系统发生种或者进化种或者达尔文种是一组具有相同祖先的生物;在时间和空间上，这个世系与其它世系保持分离。在这样一组生物在的某个时候，其成员可能分道扬镳。当其不同越来越显著的时候，这两个种群就被认为是两个不同的种了。
另请参阅孤雌生殖中的小种，涵盖了那些没有经过减数分裂或有丝分裂导致每代都在基因上与上代完全相同的物种。
对属于原核生物的细菌和古菌来说，因为不存在有性生殖，一个种除形态和生物化学特征不能有较大差别外，还必须满足rRNA序列的相似性要大于97%。
在实际操作中，这些定义通常都相一致，这些定义的不同点主要是侧重点不同而非相互否定。然而，还没有提出一个物种概念可以在无需具体分析情况下，就能完全否定、或应用于所有情况的。
物种的概念历史悠久。这之所以是最重要的分类阶元之一,有下面的原因:
它是普通人区分不同生物的基础-狗是一种，猫是另一种。
科学家通常使用标准的双名制命名法(或三名制命名法)来指代生物。
这是唯一的具有经验成分的分类阶元，比如断言两只动物是两个物种就不单单是对它们进行分类那么简单了。
在使用了几千年后，这个概念依然集中在生物学和相关学科上，也仍然被错误的定义和争论不休
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| 鲸 |
随着接触的生物愈多，人开始尝试认真把生物分类。最初，人只是以外貌与习性分类，就像中国人把大多数水上生物称作“鱼”。
在十八世纪林奈首次以生殖器官作生物分类。他似乎只是认为这样的分类有些意义，而并不是以为有近似生殖器官的物种有可联系。毕竟，当时的欧洲人相信创造论，即所有物种由神独立创造，并无任何其他的联系。可能由于创造论，林奈对一些差异极微的物种感到困惑。他因而提出一些物种为完美的，样板的；另一些则是仿造的。
及至十九世纪，多数自然学者开始明白物种是不断在变，而地球是古老得容许长时间所累积而成的巨变。因而，分类法开始强调物种之间是如何演变。拉马克认为生物可以把需要的特质遗传给后代，例如长颈鹿就是因为吹愈来愈高的树叶而长出愈来愈长的颈项。（这只是简化的描述，拉马克的理论当然远为深邃。）
拉马克最大的贡献在于提出不同物种之间可以有连续不断的系諎。他在1809年的著作ZoologicalPhilosophy是首个以逻辑理由否定创造论。当达尔文的进代论在1860年代被广为接受后，却掩盖了拉马克的贡献。及至二十世纪末，拉马克的理论从新获得重视，成为adaptivemutation的一个基础。他另一曾被舍弃的目标为本进化论，亦发展成artificialselection。
达尔文及华莱士提出的进化论是目前公认最权威和有说服力的进化理论。
物种形成是演化的一个过程，指生物分类上的物种诞生。自然界的物种形成主要有4种模型。包括异域性物种形成（Allopatricspeciation）、同域性物种形成（Sympatricspeciation）、边域性物种形成（Peripatricspeciation），与临域性物种形成（Parapatricspeciation）。
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