前身为1666年J.B.科尔贝尔创建的学会。1699年，在法国王室的赞助下改组学会，改用现名并迁往卢浮宫。法国大革命时期，国民公会于1793年取缔了科学院和其他王室学会。1795年，由新建国立研究院的一个分支机构接管科学院的工作。1816年恢复原名，成为法兰西研究院的5个组成机构之一。
法国科学院的宗旨是鼓励和保护研究精神，致力于提高教育和出版物的质量并致力于维护法兰西科学用语的纯洁性及其作用。
法国科学院由院士 、外国合作院士及通讯院士组成 。1986年11月通过的法国科学院章程规定，院士在80岁以下的总名额限定在110名，并要求自1995年1月1日起，年龄在60岁以下的院士至少应有30名；外国合作院士的名额最多可达120名；通讯院士年龄在70岁以下的，总名额限定在180名 ，其中50岁以下的通讯院士应占一半。
法国科学院有两个学部，即数学、物理及其应用科学学部和化学、自然、生物学、医学及其应用科学学部。科学院由主席团及行政委员会负责管理。
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