乙酰辅酶A是活化了的乙酸。 基团 (CH3CO- = 乙酰基)与辅酶A的半胱氨酸残基的SH-基团相连。这其实是高能键硫酯键。它是脂肪酸的beta-氧化及糖酵解后产生的丙酮酸氧化脱羧的产物。
在三羧酸循环的第一步，乙酰基转移到草酰乙酸中，生成柠檬酸。循环也叫柠檬酸循环。
乙酰辅酶A是人体内重要的化学物质。首先，丙酮酸氧化脱羧，脂酸的beta-氧化的产物。同时，它是脂酸合成，胆固醇合成和酮体生成的碳来源。三大营养物质的彻底氧化殊途同归，都会生成乙酰辅酶A以进入三羧酸循环。
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