反映南京大屠杀的纪录片《南京——被割裂的记忆》从2009年11月14日至12月4日在东京上映。令人注目的是，该片记载了日本老兵和中国受害者共13人的证言。
1937年12月13日至1938年1月的6个星期时间里，侵华日军制造了惨绝人环的南京大屠杀，中国同胞三十多万人遇害，南京城三分之一以上街道和建筑物被毁。
电影在涩谷的小剧场UPLINK上映。在一小时二十五分钟的影片中，六名日本老兵和七名中国幸存者使用了真实姓名。他们根据各自的记忆讲述了当时日本兵用刺刀集体屠杀中国人和强奸女性等情况。
据报道，三十岁的影片导演武田伦和曾看过幸存者的证言录像，受到了巨大冲击。加之祖父曾是日本兵，他决心“和相关人士直接会面，将其证言拍成纪录片”。武田与证言录像的拍摄者、二十二年前就开始调查南京大屠杀的退休小学教师松冈环合作，从2004年年底开始采访工作，前往南京近二十次。
武田说，并不是想从自虐的角度看待历史，而是希望能认识到日本曾是加害者，从加害者的角度去思考战争。特别希望在学校很少有机会学到日中现代关系史的年轻人看一看这部电影。
历史问题是中日关系中最敏感的问题之一，中日历史共同研究报告已推迟数次发布。最近，日本外相冈田克也公开表示，中日韩应合编历史教科书。日本新首相鸠山访华时也表示，日本政府会正视历史，以史为鉴。
但在日本，公众对南京大屠杀的认识却存在著广泛不同的情绪及观点，尤其是保守派，认为南京大屠杀是被夸大、甚至是凭空捏造的反日外交工具。而具体到对遇难人数的研究上，日本学界的估计，从二十万以上、四万人以上、到数百人不等，甚至还有南京大屠杀“不存在”之说。
2009年9月15日，日本名古屋市市长河村隆之质疑南京大屠杀死亡人数，他宣称有必要对死亡人数等再度进行调查。日本媒体指出，名古屋市与南京市是友好城市，河村市长的这一言论很有可能对两市的交流合作造成影响。